בשל הפיר הדק ותמיכת המתלים הגמישה, הצנטריפוגה המיוחדת גבוהה יחסית. במהלך ההתקנה, יש לספק שטח הפעלה ותחזוקה מספיק מסביב לצנטריפוגה, ויש לשמור גם על מרווח הולם מעליה. יש לספק ציוד הרמה כדי להקל על פירוק והרכבה של חלקים מסתובבים במהלך תחזוקה.
בגלל תמיכת ההשעיה, יש להבטיח את האנכיות של הפיר הראשי במהלך ההתקנה. השתמש ברמה של 0.2/1000 כדי לכייל את הציר כנגד מישור ההרכבה של המנוע. לאחר מכן, תקן את הבסיס או המסגרת ובדוק שהפיר הראשי הוא אנכי, כלומר מיושר עם מעטפת הצנטריפוגה.
יש למקם את ארון הבקרה החשמלי של הצנטריפוגה המיוחדת בחדר בקרה קרוב לאזור ההפעלה. יש לשקול דרישות סביבתיות כגון אוורור, יובש והעדר קורוזיה בפאזה אדים. בעת שימוש בבקרת ממיר תדרים, נדרשים מיזוג אוויר ומאווררי פליטה כדי להבטיח שרכיבים חשמליים יכולים לפעול כרגיל במהלך העליות והירידות התכופות של הצנטריפוגה.