צנטריפוגות אוטומטיות לחלוטין מציעות את היתרונות הבאים:
פעולה פשוטה: כל שעליך לעשות הוא להגדיר את הפרמטרים, והמכונה משלימה אוטומטית את תהליך ההפרדה, ומפחיתה התערבות אנושית.
עקביות גבוהה: בקרה אוטומטית מבטיחה תנאים עקביים לכל הפרדה, וכתוצאה מכך תוצאות יציבות יותר.
בטיחות משופרת: מצויד בפונקציות הגנת מהירות יתר והתחממות יתר, הפחתת סיכונים תפעוליים.
יעילות גבוהה יותר: יכול לעבד דגימות מרובות ברציפות, מתאים לייצור-בקנה מידה גדול או לניסויים-תפוקה גבוהה.