סביבת אחסון: הצנטריפוגה צריכה להיות ממוקמת במקום יבש, טמפרטורה-מתאימה ומאווררת היטב{{1}. הימנע מאור שמש ישיר, לחות וטמפרטורות קיצוניות כדי למנוע נזק לרכיבי הצנטריפוגה.
מיקום אחסון: יש למקם את הצנטריפוגה על משטח ישר, ולהבטיח שהיא לא תתהפך או תהיה נתונה לרעידות קשות.
טיפול במכסה צנטריפוגה: אם מכסה הצנטריפוגה ניתן להסרה, יש לפתוח אותו כדי למנוע הצטברות לחץ מופרז במהלך האחסון.
בדרך כלל אין לאחסן את הצנטריפוגה יותר משישה חודשים. לאחסון ארוך יותר, מומלץ לבצע תחזוקה הכרחית כדי להבטיח שהצנטריפוגה תמשיך לתפקד כרגיל לאחר שימוש ממושך.